IAKN Toraja di bawah Kementerian Agama berperan aktif dalam mengimplementasikan program pemerintah dalam hal moderasi beragama, hal itu ditandai dengan peresmian Rumah Moderasi Beragama IAKN Toraja oleh penggagas moderasi beragama Dr (HC). KH. Lukman Hakim Saefuddin, di lt. 3 aula pascasarjana IAKN Toraja dan dihadiri Rektor IAKN Toraja, perangkat rektor, pegawai, mahasiswa, dan tokoh-tokoh agama disekitar kampus IAKN Toraja.